Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC1Q8IVP5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FUNDC1Q8IVP5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC1Q8IVP5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms