Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRNIPQ6NTE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms