Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC2DQ5SRD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC2DQ5SRD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms