Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN1Q16658 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSCN1Q16658 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN1Q16658 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms