Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC1Q15915 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC1Q15915 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms