Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB35Q15286 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB35Q15286 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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RAB35Q15286 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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RAB35Q15286 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RAB35Q15286 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RAB35Q15286 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB35Q15286 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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RAB35Q15286 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB35Q15286 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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