Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SQLEQ14534 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SQLEQ14534 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SQLEQ14534 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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