Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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