Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF2Q12772 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF2Q12772 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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