Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS13P62277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS13P62277 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS13P62277 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS13P62277 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS13P62277 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS13P62277 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS13P62277 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS13P62277 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS13P62277 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS13P62277 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS13P62277 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS13P62277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS13P62277 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS13P62277 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS13P62277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS13P62277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms