Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM11AP58511 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM11AP58511 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM11AP58511 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM11AP58511 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM11AP58511 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM11AP58511 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM11AP58511 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM11AP58511 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms