Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKNOX1P55347 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKNOX1P55347 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKNOX1P55347 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKNOX1P55347 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms