Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT3P49368 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT3P49368 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCT3P49368 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCT3P49368 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCT3P49368 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT3P49368 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT3P49368 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT3P49368 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT3P49368 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT3P49368 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT3P49368 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms