Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2BP42772 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms