Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCIP41743 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms