Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGM1P36871 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGM1P36871 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGM1P36871 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PGM1P36871 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGM1P36871 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGM1P36871 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGM1P36871 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGM1P36871 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGM1P36871 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGM1P36871 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGM1P36871 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGM1P36871 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGM1P36871 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms