Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX11P35716 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX11P35716 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOX11P35716 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX11P35716 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX11P35716 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX11P35716 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX11P35716 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX11P35716 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX11P35716 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms