Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMB4P28070 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB4P28070 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms