Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 YJL068CYJL068C 900 nt5.57□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SEC13YLR208W 894 nt5.57□□□□□ -1.52
LRE1P25579 MKC7YDR144C 1791 nt5.57□□□□□ -1.52
LRE1P25579 MPC54YOR177C 1395 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 GEX1YCL073C 1848 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 GEX2YKR106W 1848 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YEL028WYEL028W 462 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YGL072CYGL072C 360 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YGR066CYGR066C 879 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SCW4YGR279C 1161 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 GAT4YIR013C 366 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SKG1YKR100C 1068 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 LDB18YLL049W 540 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YJR015WYJR015W 1533 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SEC12YNR026C 1416 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 VMS1YDR049W 1899 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YIL055CYIL055C 1884 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 DPH2YKL191W 1605 nt5.56□□□□□ -1.52
LRE1P25579 HXT15YDL245C 1704 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 HXT16YJR158W 1704 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 snR57snR57 88 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SIP2YGL208W 1248 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YIL060WYIL060W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 ERP2YAL007C 648 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 MSA2YKR077W 1092 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 EMW1YNL313C 2715 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 TAH18YPR048W 1872 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 DDC1YPL194W 1839 nt5.55□□□□□ -1.52
LRE1P25579 AVO1YOL078W 3531 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 KEL1YHR158C 3495 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YEL074WYEL074W 339 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YHR095WYHR095W 495 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YLL017WYLL017W 312 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 VTA1YLR181C 993 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 PPA2YMR267W 933 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 NDJ1YOL104C 1059 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 ETR1YBR026C 1143 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 FES1YBR101C 873 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 TRP5YGL026C 2124 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YGL036WYGL036W 2730 nt5.54□□□□□ -1.52
LRE1P25579 PPR1YLR014C 2715 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 OSW5YMR148W 447 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 YGP1YNL160W 1065 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 PSH1YOL054W 1221 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 BBP1YPL255W 1158 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 SCT1YBL011W 2280 nt5.53□□□□□ -1.52
LRE1P25579 HRP1YOL123W 1605 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 CYC8YBR112C 2901 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 CBF1YJR060W 1056 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SFC1YJR095W 969 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 APN1YKL114C 1104 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 PNP1YLR209C 936 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 NDC1YML031W 1968 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 HXT17YNR072W 1695 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 DHH1YDL160C 1521 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ULA1YPL003W 1389 nt5.52□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ESC8YOL017W 2145 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 HST4YDR191W 1113 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 EDC1YGL222C 528 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YBL044WYBL044W 369 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 NCE103YNL036W 666 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 RHO2YNL090W 579 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 RER2YBR002C 861 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 HSP26YBR072W 645 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 RRT2YBR246W 1164 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 VHS1YDR247W 1386 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YLH47YPR125W 1365 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 UTP9YHR196W 1728 nt5.51□□□□□ -1.53
LRE1P25579 QRI1YDL103C 1434 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ASH1YKL185W 1767 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SKI8YGL213C 1194 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 PRP45YAL032C 1140 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ADD66YKL206C 804 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 RPS19BYNL302C 435 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ROX3YBL093C 663 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 GPM3YOL056W 912 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 NPT1YOR209C 1290 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SSO1YPL232W 873 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 THI21YPL258C 1656 nt5.5□□□□□ -1.53
LRE1P25579 PCL9YDL179W 915 nt5.49□□□□□ -1.53
LRE1P25579 REX3YLR107W 1215 nt5.49□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YPR098CYPR098C 486 nt5.49□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YPR109WYPR109W 885 nt5.49□□□□□ -1.53
LRE1P25579 NFI1YOR156C 2181 nt5.49□□□□□ -1.53
LRE1P25579 LAP2YNL045W 2016 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 FRE7YOL152W 1863 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 CDC43YGL155W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YBL029WYBL029W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 NOP13YNL175C 1212 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 MRI1YPR118W 1236 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 ARR1YPR199C 885 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SSK22YCR073C 3996 nt5.48□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SOH1YGL127C 384 nt5.47□□□□□ -1.53
LRE1P25579 SUA5YGL169W 1281 nt5.47□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YPT32YGL210W 669 nt5.47□□□□□ -1.53
LRE1P25579 YAP1YML007W 1953 nt5.47□□□□□ -1.53
LRE1P25579 HAS1YMR290C 1518 nt5.47□□□□□ -1.53
LRE1P25579 RMD9YGL107C 1941 nt5.46□□□□□ -1.53
LRE1P25579 EFT2YDR385W 2529 nt5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms