Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2O75044 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP2O75044 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP2O75044 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms