Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXN3O00409 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXN3O00409 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXN3O00409 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms