Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3CLB5ME19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3CLB5ME19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3CLB5ME19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms