Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRIQ3A6PVS8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms