Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COG6Q9Y2V7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG6Q9Y2V7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COG6Q9Y2V7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms