Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF560Q96MR9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF560Q96MR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms