Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTLQ8NG68 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLQ8NG68 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLQ8NG68 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms