Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf163Q8N9P6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf163Q8N9P6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf163Q8N9P6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms