Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC83Q8IWF9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC83Q8IWF9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC83Q8IWF9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms