Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFWD3Q6PCD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFWD3Q6PCD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFWD3Q6PCD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms