Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00242Q5T6M2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00242Q5T6M2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.2 ms