Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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GTF3C1Q12789 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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GTF3C1Q12789 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF3C1Q12789 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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GTF3C1Q12789 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GTF3C1Q12789 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GTF3C1Q12789 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GTF3C1Q12789 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GTF3C1Q12789 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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GTF3C1Q12789 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF3C1Q12789 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF3C1Q12789 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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