Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 ATG20YDL113C 1923 nt7.72□□□□□ -1.17
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TY2B-BQ12491 ECM3YOR092W 1842 nt7.72□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.71□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 PDB1YBR221C 1101 nt7.71□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 YNL040WYNL040W 1371 nt7.71□□□□□ -1.17
TY2B-BQ12491 ATE1YGL017W 1512 nt7.71□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 PPM1YDR435C 987 nt7.71□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 NIT2YJL126W 924 nt7.71□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 YBL010CYBL010C 843 nt7.71□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 ERD1YDR414C 1089 nt7.7□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 BNA6YFR047C 888 nt7.7□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 NAG1YGR031C-A 492 nt7.7□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 RAD57YDR004W 1383 nt7.7□□□□□ -1.18
TY2B-BQ12491 GLN3YER040W 2193 nt7.7□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 CIN5YOR028C 888 nt7.69□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 CLB1YGR108W 1416 nt7.69□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 PGA2YNL149C 390 nt7.69□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 BSP1YPR171W 1731 nt7.66□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 YBL044WYBL044W 369 nt7.65□□□□□ -1.18
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TY2B-BQ12491 HXT16YJR158W 1704 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 MRM2YGL136C 963 nt7.54□□□□□ -1.2
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TY2B-BQ12491 HXT4YHR092C 1731 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 FOX2YKR009C 2703 nt7.54□□□□□ -1.2
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TY2B-BQ12491 SUP54tL(CAA)G2 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 SPL2YHR136C 447 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 FUN19YAL034C 1242 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 MAG2YLR427W 2013 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-BQ12491 RPL7AYGL076C 735 nt7.52□□□□□ -1.21
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