Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 CDC43YGL155W 1131 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 ARR3YPR201W 1215 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 MRPL36YBR122C 534 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 MCX1YBR227C 1563 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 TNA1YGR260W 1605 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 ATE1YGL017W 1512 nt4.72□□□□□ -1.65
USB1Q12208 SNF3YDL194W 2655 nt4.71□□□□□ -1.65
USB1Q12208 YOR1YGR281W 4434 nt4.71□□□□□ -1.65
USB1Q12208 GEP3YOR205C 1671 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YLL059CYLL059C 507 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 UBC4YBR082C 447 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YIL067CYIL067C 2037 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YAP1801YHR161C 1914 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 FET3YMR058W 1911 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RSC30YHR056C 2652 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SHE10YGL228W 1734 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 BPL1YDL141W 2073 nt4.71□□□□□ -1.66
USB1Q12208 DBF2YGR092W 1719 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YGL185CYGL185C 1140 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 TFS1YLR178C 660 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 LST8YNL006W 912 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 POR1YNL055C 852 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YPR098CYPR098C 486 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 GLT1YDL171C 6438 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SEC12YNR026C 1416 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 HOF1YMR032W 2010 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ATH1YPR026W 3636 nt4.7□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ARB1YER036C 1833 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 EXO1YOR033C 2109 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 VMA16YHR026W 642 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YLR296WYLR296W 327 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YNR048WYNR048W 1182 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 CAM1YPL048W 1248 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SFB3YHR098C 2790 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SEC39YLR440C 2130 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RRN3YKL125W 1884 nt4.69□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ASH1YKL185W 1767 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 NUP1YOR098C 3231 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RHB1YCR027C 630 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 GLO2YDR272W 825 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RPT6YGL048C 1218 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SCW4YGR279C 1161 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 EPS1YIL005W 2106 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 QRI1YDL103C 1434 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ADE13YLR359W 1449 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 STE20YHL007C 2820 nt4.68□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ACF2YLR144C 2340 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 CWC21YDR482C 408 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 ORM1YGR038W 669 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 PGU1YJR153W 1086 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 MRP17YKL003C 396 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YNL019CYNL019C 855 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YNL033WYNL033W 855 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 DAL82YNL314W 768 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RIM15YFL033C 5313 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 DED81YHR019C 1665 nt4.67□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RPT1YKL145W 1404 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 CAD1YDR423C 1230 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 GRX4YER174C 735 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 COG1YGL223C 1254 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YJR085CYJR085C 318 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 MTQ1YNL063W 945 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 GPM3YOL056W 912 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 RGT1YKL038W 3513 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 DNF2YDR093W 4839 nt4.66□□□□□ -1.66
USB1Q12208 GAS3YMR215W 1575 nt4.65□□□□□ -1.66
USB1Q12208 MPP10YJR002W 1782 nt4.65□□□□□ -1.66
USB1Q12208 HRP1YOL123W 1605 nt4.65□□□□□ -1.66
USB1Q12208 SMF3YLR034C 1422 nt4.65□□□□□ -1.66
USB1Q12208 WTM2YOR229W 1404 nt4.65□□□□□ -1.66
USB1Q12208 YDL034WYDL034W 345 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 VCX1YDL128W 1236 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YKR041WYKR041W 753 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YBL044WYBL044W 369 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 CKA2YOR061W 1020 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 ECM33YBR078W 1290 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 UBA2YDR390C 1911 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 PDH1YPR002W 1551 nt4.65□□□□□ -1.67
USB1Q12208 APL6YGR261C 2430 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 FOL1YNL256W 2475 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 RPS19BYNL302C 435 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 CBC2YPL178W 627 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 GSY2YLR258W 2118 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 HPF1YOL155C 2904 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 RTT106YNL206C 1368 nt4.64□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YHR045WYHR045W 1683 nt4.64□□□□□ -1.67
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