Protein–RNA interactions for Protein: Q06336

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GGA1Q06336 TEF2YBR118W 1377 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 BUD9YGR041W 1644 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SIF2YBR103W 1608 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YKR073CYKR073C 321 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 RPS9AYPL081W 594 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 NGR1YBR212W 2019 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.46□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 DOA1YKL213C 2148 nt5.45□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 RRP4YHR069C 1080 nt5.45□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 IDP3YNL009W 1263 nt5.45□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 MOT2YER068W 1764 nt5.44□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 PRP46YPL151C 1356 nt5.44□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 MBP1YDL056W 2502 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 STL1YDR536W 1710 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SEC12YNR026C 1416 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 UBP9YER098W 2265 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 GAL4YPL248C 2646 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YER187WYER187W 426 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 NQM1YGR043C 1002 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 AAD15YOL165C 432 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SNT2YGL131C 4212 nt5.43□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 MTQ2YDR140W 666 nt5.42□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YGR016WYGR016W 573 nt5.42□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.42□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 PCA1YBR295W 3651 nt5.42□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 COR1YBL045C 1374 nt5.42□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 MSE1YOL033W 1611 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 NUP116YMR047C 3342 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 GLO2YDR272W 825 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 CDC43YGL155W 1131 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SRY1YKL218C 981 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 HOF1YMR032W 2010 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YMD8YML038C 1329 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SSZ1YHR064C 1617 nt5.41□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 UGA1YGR019W 1416 nt5.4□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 SMF3YLR034C 1422 nt5.4□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 FOL1YNL256W 2475 nt5.4□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 CLF1YLR117C 2064 nt5.4□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YKR041WYKR041W 753 nt5.4□□□□□ -1.54
GGA1Q06336 YEA6YEL006W 1008 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 SFK1YKL051W 1062 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 PEX32YBR168W 1242 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 SSY5YJL156C 2100 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 FZO1YBR179C 2568 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 SYG1YIL047C 2709 nt5.39□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 TDA7YNL176C 1911 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 BUL1YMR275C 2931 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 ABF1YKL112W 2196 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 HXT3YDR345C 1704 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 MOG1YJR074W 657 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YBL044WYBL044W 369 nt5.38□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 MNS1YJR131W 1650 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 ARB1YER036C 1833 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 SOL1YNR034W 966 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 TGS1YPL157W 948 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 ATG12YBR217W 561 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 PDI1YCL043C 1569 nt5.37□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 FRE1YLR214W 2061 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 NPY1YGL067W 1155 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YAR061WYAR061W 204 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 SHM1YBR263W 1473 nt5.36□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 MKC7YDR144C 1791 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 MRK1YDL079C 1506 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YCL065WYCL065W 369 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 DFM1YDR411C 1026 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 VMA16YHR026W 642 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 ENV7YPL236C 1095 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YGR266WYGR266W 2106 nt5.35□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 UTP7YER082C 1665 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 HAP1YLR256W 4509 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 HFI1YPL254W 1467 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 ORC5YNL261W 1440 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YRA1YDR381W 681 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 FMP33YJL161W 543 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 YPR195CYPR195C 330 nt5.34□□□□□ -1.55
GGA1Q06336 RPT4YOR259C 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 MPH2YDL247W 1830 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 MRF1YGL143C 1242 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 YLR184WYLR184W 348 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 CDC21YOR074C 915 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 UGO1YDR470C 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 RPL12AYEL054C 498 nt5.32□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 PCT1YGR202C 1275 nt5.32□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 VHC1YBR235W 3363 nt5.32□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 AIM17YHL021C 1398 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 CAF4YKR036C 1932 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 HRP1YOL123W 1605 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 FYV1YDR024W 486 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 RPL34AYER056C-A 366 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 BRF1YGR246C 1791 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 BRL1YHR036W 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 SAP155YFR040W 3009 nt5.3□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 KRS1YDR037W 1776 nt5.3□□□□□ -1.56
GGA1Q06336 MPP10YJR002W 1782 nt5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.9 ms