Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3AQ05086 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE3AQ05086 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3AQ05086 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms