Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	GAL10	YBR019C	2100 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	ECM33	YBR078W	1290 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SUE1	YPR151C	621 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YHR131C	YHR131C	2553 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	MCX1	YBR227C	1563 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	BLM10	YFL007W	6432 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SED4	YCR067C	3198 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	NAG1	YGR031C-A	492 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	RPL21B	YPL079W	483 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	ICE2	YIL090W	1476 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	CDC19	YAL038W	1503 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	MMP1	YLL061W	1752 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	NOT3	YIL038C	2511 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SNU71	YGR013W	1863 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	HGH1	YGR187C	1185 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	CBF1	YJR060W	1056 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	STE7	YDL159W	1548 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	PAL1	YDR348C	1500 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	NUD1	YOR373W	2556 nt		3.37	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	COQ6	YGR255C	1440 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	PHO8	YDR481C	1701 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	BRE2	YLR015W	1518 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	LHP1	YDL051W	828 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SFT2	YBL102W	648 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	HXT14	YNL318C	1623 nt		3.36	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	PRR1	YKL116C	1557 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YJL068C	YJL068C	900 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	NIT2	YJL126W	924 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	MRP17	YKL003C	396 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	DCN1	YLR128W	810 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YNL019C	YNL019C	855 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YNL033W	YNL033W	855 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	MRI1	YPR118W	1236 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	QCR2	YPR191W	1107 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	ZUO1	YGR285C	1302 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	THP1	YOL072W	1368 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	RSC6	YCR052W	1452 nt		3.35	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	UBP9	YER098W	2265 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	PMT2	YAL023C	2280 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SUA5	YGL169W	1281 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YHR127W	YHR127W	732 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	POM33	YLL023C	840 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	SOL1	YNR034W	966 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	KTR3	YBR205W	1215 nt		3.34	□□□□□ -1.87
DDR2	P89113	ACS2	YLR153C	2052 nt		3.34	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	VPS1	YKR001C	2115 nt		3.34	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	RCK1	YGL158W	1539 nt		3.34	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	FAT3	YKL187C	2253 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	JIP4	YDR475C	2631 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	CYK3	YDL117W	2658 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YAP1	YML007W	1953 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	AUA1	YFL010W-A	285 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	BUD14	YAR014C	2130 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	SSP120	YLR250W	705 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	SCW10	YMR305C	1170 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	snR10	snR10	245 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	UBX7	YBR273C	1311 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ADE4	YMR300C	1533 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ADE3	YGR204W	2841 nt		3.33	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YER084W	YER084W	387 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YER187W	YER187W	426 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ZRT1	YGL255W	1131 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TDH3	YGR192C	999 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	KTI12	YKL110C	942 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	RER2	YBR002C	861 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ETR1	YBR026C	1143 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	MET31	YPL038W	534 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ASA1	YPR085C	1332 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	PRO2	YOR323C	1371 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ROT2	YBR229C	2865 nt		3.32	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TPS3	YMR261C	3165 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	FUI1	YBL042C	1920 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	SLC1	YDL052C	912 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	EGD2	YHR193C	525 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	FUN19	YAL034C	1242 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YAR061W	YAR061W	204 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	SNN1	YNL086W	309 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YBL070C	YBL070C	321 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	NRM1	YNR009W	750 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	RPL3	YOR063W	1164 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TKL1	YPR074C	2043 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	PWP1	YLR196W	1731 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	LUC7	YDL087C	786 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TRS23	YDR246W	660 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TRX2	YGR209C	315 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YMR245W	YMR245W	621 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	MRP21	YBL090W	534 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ELP2	YGR200C	2367 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	SIF2	YBR103W	1608 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	NGL2	YMR285C	1548 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	TUP1	YCR084C	2142 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	UBA2	YDR390C	1911 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	RPR2	YIR015W	435 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YLR118C	YLR118C	684 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	ZPS1	YOL154W	750 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DDR2	P89113	YPL102C	YPL102C	303 nt		3.29	□□□□□ -1.88

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