Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN2AP68543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN2AP68543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms