Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00310P59036 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00310P59036 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms