Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIF1P55008 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIF1P55008 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AIF1P55008 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AIF1P55008 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIF1P55008 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIF1P55008 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIF1P55008 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AIF1P55008 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AIF1P55008 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIF1P55008 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIF1P55008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIF1P55008 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIF1P55008 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AIF1P55008 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AIF1P55008 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AIF1P55008 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AIF1P55008 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AIF1P55008 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIF1P55008 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AIF1P55008 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AIF1P55008 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AIF1P55008 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AIF1P55008 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
AIF1P55008 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AIF1P55008 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AIF1P55008 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms