Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSC2P49815 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSC2P49815 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC2P49815 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSC2P49815 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC2P49815 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC2P49815 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC2P49815 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSC2P49815 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC2P49815 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSC2P49815 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC2P49815 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC2P49815 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC2P49815 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSC2P49815 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSC2P49815 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSC2P49815 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSC2P49815 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSC2P49815 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSC2P49815 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC2P49815 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC2P49815 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC2P49815 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC2P49815 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms