Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP13P45452 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP13P45452 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP13P45452 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP13P45452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP13P45452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP13P45452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP13P45452 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP13P45452 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP13P45452 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP13P45452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP13P45452 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP13P45452 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP13P45452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP13P45452 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP13P45452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP13P45452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP13P45452 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP13P45452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP13P45452 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms