Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR7P32248 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR7P32248 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR7P32248 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR7P32248 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR7P32248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR7P32248 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR7P32248 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR7P32248 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR7P32248 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR7P32248 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR7P32248 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR7P32248 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR7P32248 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR7P32248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR7P32248 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR7P32248 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR7P32248 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR7P32248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR7P32248 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR7P32248 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR7P32248 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR7P32248 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR7P32248 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR7P32248 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR7P32248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR7P32248 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR7P32248 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR7P32248 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR7P32248 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR7P32248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms