Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A4P31645 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A4P31645 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms