Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCEA1P23193 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA1P23193 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms