Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PVALBP20472 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PVALBP20472 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PVALBP20472 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PVALBP20472 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PVALBP20472 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PVALBP20472 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PVALBP20472 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PVALBP20472 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PVALBP20472 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PVALBP20472 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PVALBP20472 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PVALBP20472 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PVALBP20472 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PVALBP20472 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PVALBP20472 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms