Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN1P18031 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN1P18031 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms