Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME1P15531 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME1P15531 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME1P15531 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME1P15531 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME1P15531 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME1P15531 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME1P15531 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME1P15531 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME1P15531 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME1P15531 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME1P15531 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME1P15531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME1P15531 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME1P15531 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME1P15531 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME1P15531 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME1P15531 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME1P15531 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME1P15531 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME1P15531 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME1P15531 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME1P15531 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME1P15531 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME1P15531 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME1P15531 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME1P15531 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME1P15531 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms