Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP1P09874 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP1P09874 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP1P09874 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP1P09874 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP1P09874 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP1P09874 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP1P09874 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP1P09874 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP1P09874 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP1P09874 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP1P09874 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARP1P09874 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP1P09874 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP1P09874 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP1P09874 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP1P09874 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP1P09874 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP1P09874 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARP1P09874 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP1P09874 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP1P09874 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP1P09874 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP1P09874 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARP1P09874 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP1P09874 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP1P09874 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP1P09874 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP1P09874 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PARP1P09874 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP1P09874 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms