Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPAP09012 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPAP09012 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms