Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BNIP3LO60238 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BNIP3LO60238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms